
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物体 为其提供 TMT淀粉酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
的研究最后
研究方案的人员与探讨伴随速冻耗时段提高牛羊肉的密度、持混流式水轮机、光色、解离铁含氧量、ROS、脂质过防非金属氧化物、MDA、GSH和GPX4平行来分析健身肌肉组织化人体肿瘤细胞的铁致死状况。导致提示 ,速冻耗时段提高后,牛羊肉的密度在第5天和第6天相关系数变低;持水效率减低;外表颜色变深,逐渐耗尽色泽,鲜朱粉红色换成暗朱粉红色。最后,解离铁、几丁质酶氧和MDA的含氧量相关系数增强,人体肿瘤细胞凋亡率相关系数变高。 学习的人员取出区别保鲜冷库时的肌群检样的核胆固醇,之后实行SDS-PAGE解析,核胆固醇条带在区别年代地域分布不规则且类似(图1a)。要根据核淀粉酶在区别检样中的形容现状,解析发现了一模一样组检样的中个数相当于一模一样平行(图1b),讲解肌群检样核胆固醇有很好的组内类似性和组间文化差异形。 蛋清质组学共技术鉴别出1996种蛋清质。以B0为差表组,淘汰B1、B2、B4和B6中的蛋清通过不一致性抒发概述,共技术鉴别到376个DEPs。将火山图大数据可视化,并要根据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两根标准单位概述DEP。成果如1c-f图甲中,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别技术鉴别出22、33、73和140个DEPs,至少分发型别上涨6、11、32和815个,下跌16、22、41和53个。聚类分析法最简单的方法开展了各个保鲜的阶段相关全身肌肉组织安排中蛋清质的抒发,成果提示 相关全身肌肉蛋清抒发不一致性跟着存放时的加入而加入(图1g)。
图1| 区别冷藏库日期的背部肌肉样件蛋白酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有所不同冰箱耗时的健身肌肉原材料不同球蛋白浅析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁枯死蛋白酶肽的PRM降钙素原检测数据分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 依据KEGG丰度差别把你想表达出来血清的铁死亡视频管理机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物工程提供了TMT降钙素原检测淀粉酶质组学水平服務,拜谱动物已研发项目管理已完成并设立了健全完善的转录组学、淀粉酶组学、产生组学或两组学合作物料水平服務指标体系,欢迎致电咨询!
对比文献资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.